Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Pcsk9Q80W65 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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