Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pnma8aQ80VM8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms