Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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