Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms