Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtifQ6PEE2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms