Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Frg2f1Q6P3A2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Frg2f1Q6P3A2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms