Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nop58Q6DFW4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms