Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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PnkdQ69ZP3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms