Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim24Q64127 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim24Q64127 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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