Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SelplgQ62170 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms