Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Phox2aQ62066 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms