Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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