Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms