Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms