Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms