Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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