Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030870Q3V2G4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC030870Q3V2G4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms