Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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