Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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