Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam117bQ3U3E2 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms