Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms