Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms