Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms