Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrna5Q2MKA5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms