Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms