Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms