Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MestQ07646 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MestQ07646 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MestQ07646 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms