Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Crisp3Q03402 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms