Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddr1Q03146 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms