Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VcpQ01853 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VcpQ01853 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VcpQ01853 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VcpQ01853 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms