Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms