Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23aQ01405 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms