Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms