Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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