Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chl1P70232 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chl1P70232 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms