Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms