Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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