Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rad23bP54728 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rad23bP54728 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23bP54728 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rad23bP54728 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rad23bP54728 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rad23bP54728 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rad23bP54728 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rad23bP54728 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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