Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms