Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpbP50405 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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