Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Nedd1P33215 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms