Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprmP28828 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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