Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp1P28563 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms