Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NfyaP23708 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms