Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3aP23116 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3aP23116 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3aP23116 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3aP23116 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eif3aP23116 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms