Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18532 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18532 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18532 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18532 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms