Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms