Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col3a1P08121 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col3a1P08121 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms