Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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