Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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BlmO88700 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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BlmO88700 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BlmO88700 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BlmO88700 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms